Jak ustalić podstawę opodatkowania świadczonych usług serwisowych

Nasza spółka świadczy usługi serwisowe silników maszyn produkcyjnych. Pracownicy spółki dojeżdżają samochodami do miejsca, w którym znajduje się uszkodzona maszyna. Używane przez pracowników pojazdy w części są własnością spółki, w części są leasingowane, a część samochodów jest własnością pracowników. Zdarza się, że spółka ponosi również koszty zakwaterowania pracowników w miejscowościach, w których dokonywane są naprawy. Czasami pracownicy odbywają podróż drogą lotniczą. Wynagrodzenie spółki jest sumą poszczególnych elementów kosztowych, takich jak wartość robocizny, koszt użycia samochodu, koszty przelotów czy zakwaterowania. Elementy te są wyodrębniane przez spółkę na wystawianych kontrahentom fakturach. Czy spółka postępuje prawidłowo? Niedawno dowiedzieliśmy się, że dodatkowe koszty związane z wykonywanymi usługami serwisowymi powinniśmy wliczać do jej podstawy opodatkowania i nie wyodrębniać na fakturze. Czy to prawda?